Nasce ad Huntington Beach, California, da madre di origini italiane e padre di origini tedesche; ha un fratello di nome Matt, ex compagno di scuola di Johnny Christ, che come lui suona la chitarra e fa parte della band The Dear And Departed e una sorella di nome Zina. A differenza di come crede la maggior parte della gente, il suo secondo nome non è Jonathan, bensi' James. Ha un cane di nome Ichabod Crane al quale e' molto legato e per il quale ha anche fondato anche un myspace. Insieme a M Shadows, e' uno dei fondatori degli Avenged Sevenfold e l'inventore dell'abbreviazione A7X in cui la A sta per Avenged, il 7 per Seven e la X per Fold. Ha anche scelto lui il soprannome di Johnny Christ per Johnny, bassista della band. Prima di fondare gli A7X insieme a Matt nel 1999, suonava nella band punk MPA (Mad Porn Action). L'origine del suo nickname e' da ricercarsi alle scuole superiori, durante le quali ha avuto non pochi problemi con gli altri ragazzi, che spesso lo consideravano uno "sfigato"; da li' il soprannome di Zacky Vengeance, la parola Vengeance indica quindi una sorta di vendetta contro chi non credeva in lui. Ha studiato alla Huntington Beach High School, stessa scuola che hanno frequentato anche M Shadows e The Rev. Durante il periodo delle scuole superiori, venne arrestato per aver rubato tutti i microfoni della sua scuola. Ha imparato a suonare la chitarra da autodidatta a 13 anni, esercitandosi con quella del padre. E' mancino e cio' gli permette di suonare spesso spalla a spalla con Synyster Gates durante i concerti. Prima dell'inserimento di Syn nella band, Zacky era l'unico chitarrista, salvo in "To The End The Rapture (Heavy Metal Version)" presente nella ristampa del cd, in cui suona anche Synyster. Come Syn, Zacky sponsorizza dal 2004 la Schecter Guitar Research e usa le Seymour Duncan Pickups, anche se recentemente realizzato una chitarra personalizzata che ha lui stesso disegnato. Tra i suoi artisti preferiti troviamo soprattutto band punk come Rancid, Misfits e Bad Religion, ma gli piacciono anche i Metallica e i Guns 'N Roses. I suoi chitarristi preferiti sono Dimebag Darrel e Slash. Il suo amore per i Misfits l'ha portato addirittura a tatuarsi il loro simbolo sul suo corpo. I tatuaggi, appunto, sono una sua grandissima passione; ne ha molti, tra cui anche uno dedicato a Mickey Mouse. Ama la pizza, la birra (la sua preferita e' la Corona) e il baseball; odia il sole. Alle superiori era nella squadra di baseball, e gli piaceva talmente tanto, che se non avesse intrapreso la carriera di musicista con gli Avenged Sevenfold, sarebbe voluto diventare un giocatore di baseball professionista. Il suo primo lavoro fu in un coffee shop. Ha una linea d'abbigliamento, la Vengeance University, che ha recentemente aperto le vendite a tutto il mondo. In molti dei capi che propone, appare la scritta 6661 che equivale a 1999, anno di nascita degli Avenged Sevenfold, rovesciato. La sua fidanzata Gena, pare sia la parucchiera del gruppo e possiede il Baker, ovvero un negozio (un salone visto le dimesioni) compratole dallo stesso Zacky Vee, in cui lei puo' svolgere il suo lavoro di parrucchiera e in cui spesso i fan si recano da lei per farsi tagliare i capelli.